In de knock-out fase speelden de teams twee keer tegen elkaar, zowel uit als thuis. De finale bestond uit één wedstrijd gespeeld op neutraal terrein. De regels voor de loting in elke ronde waren als volgt:
In de loting voor de 16de finale werden de zestien teams met de hoogste UEFA coëfficiënt gescheiden van de andere zestien teams in twee verschillende potten. De teams uit pot één speelden de eerste wedstrijd uit en de tweede thuis. Teams uit hetzelfde land konden elkaar niet loten.
In de loting voor de 8ste finale werden de acht teams met de hoogste UEFA coëfficiënt gescheiden van de andere acht teams in twee verschillende potten. De teams uit pot één speelden de eerste wedstrijd uit en de tweede thuis. Teams uit hetzelfde land konden elkaar niet loten.
Vanaf de loting voor de kwartfinale gingen alle teams in één pot. Teams uit hetzelfde land konden elkaar wel loten.
Laatste 32
Eerste ronde, eerste wedstrijd Ajax vs Sparta Praag (2–0)