Stoke City FC in het seizoen 1999/00

Dit artikel beschrijft de prestaties van de Engelse voetbalclub Stoke City FC in het seizoen 1999–2000. De club uit Stoke-on-Trent kwam voor de 92ste keer uit in het Engelse profvoetbal. Het was het zesde seizoen dat Stoke City in de Football League Second Division speelde, inmiddels de derde divisie van het Engelse profvoetbal sinds de introductie (seizoen 1992–1993) van de Premier League.

Na de achtste plaats in het voorafgaande seizoen eindigden The Potters ditmaal op de zesde plaats in de eindrangschikking van de op twee na hoogste divisie. De club stond onder leiding van Gary Megson, die op 1 juli 1999 aantrad als opvolger van de vertrokken Brian Little. Hij was echter tweede keuze. Eerste keus Tony Pulis bedankte voor de eer. Hij gaf openlijk toe weinig vertrouwen te hebben in de clubleiding.

Megson moest op 15 november, een dag na de 1-1 tegen Bristol City, plaatsmaken voor de voormalige bondscoach van IJsland, Guðjón Þórðarson. Diens komst was vooral het gevolg van het feit dat de club werd overgenomen door een IJslandse investeringsmaatschappij.

De club deed lange tijd mee in de subtop en wist zich uiteindelijk te plaatsen voor de play-offs voor promotie. Daarin was Stoke echter niet opgewassen tegen Gillingham. Op de 3-2 thuisoverwinning volgde een 3-0 nederlaag, waardoor Gillingham zich plaatste voor de finale.

Stoke won dit seizoen de Football League Trophy door in de finale met 2-1 te winnen van Bristol City. James O'Connor werd aan het einde van het seizoen uitgeroepen tot Player of the Season.