| Seizoen | Competitie | Niveau | Eindstand | Pokal[1] | Opmerking |
| SC Cottbus |
| 1963/64 | DDR-Liga Groep Noord | II | 3 | 1e ronde | < BSG Motor Görlitz: 2-3 |
| 1964/65 | 2 | 2e ronde | < SC Neubrandenburg: 0-2 |
| BSG Energie Cottbus |
| 1965/66 | DDR-Liga Groep Noord | II | 3 | 2e ronde | < SC Motor Jena: 0-2 |
| 1966/67 | 3 | 2e ronde | < 1. FC Lokomotive Leipzig: 0-1 |
| 1967/68 | 2 | 8e finale | < 1. FC Union Berlin: 1-1 (nv) / 0-1 |
| 1968/69 | 5 | 1e ronde | < BSG Motor Babelsberg: 1-2 |
| 1969/70 | 4 | 8e finale | < 1. FC Lokomotive Leipzig: 0-5; 2e in promotieserie; Liga-topscorer: Peter Effenberger (21) |
| 1970/71 | 4 | tussenronde | < Stahl Eisenhüttenstadt: 1-3 |
| 1971/72 | DDR-Liga Groep B | 3 | tussenronde | < BSG Chemie Glauchau: 2-3 (nv) |
| 1972/73 | 2 | 1e ronde | < BSG Chemie Buna Schkopau: 1-2; 2e in promotieserie; Liga-topscorer: Peter Effenberger (16) |
| 1973/74 | DDR-Oberliga | I | 14 | halve finale | < FC Carl Zeiss Jena: 1-1 / 1-7 |
| 1974/75 | DDR-Liga Groep D | II | 1 | 2e ronde | < Dynamo Dresden: 1-2 (nv); 2e in promotieserie; Ligatopscorer: Erhard Gröger (13) |
| 1975/76 | DDR-Oberliga | I | 14 | 8e finale | < 1. FC Magdeburg: 0-3 / 0-3 |
| 1976/77 | DDR-Liga Groep D | II | 5 | tussenronde | < BSG Stahl Hennigsdorf: 1-2; Ligatopscorer: Erhard Gröger (15) |
| 1977/78 | 2 | 8e finale | < FC Vorwärts Frankfurt/Oder: 2-1 / 0-4 |
| 1978/79 | 1 | kwartfinale | < Dynamo Dresden: 1-4 / 0-2; 4e plaats promotieserie; Liga-topscorer: Peter Zierau (17) |
| 1979/80 | 1 | 2e ronde | < Hansa Rostock: 1-4; 3e plaats promotieserie; Liga-topscorer: Peter Zierau (19) |
| 1980/81 | 1 | 1e ronde | < BSG Chemie PCK Schwedt II: 3-4 (nv); 1e in promotieserie |
| 1981/82 | DDR-Oberliga | I | 13 | halve finale | < Dynamo Dresden: 1-4 |
| 1982/83 | DDR-Liga Groep B | II | 3 | 2e ronde | < BSG Motor West Karl-Marx-Stadt: 2-4 |
| 1983/84 | 4 | 1e ronde | < BSG Fortschritt Wittstock: 0-1 |
| 1984/85 | DDR-Liga Groep A | 4 | 1e ronde | < Fortschritt Weida: 1-2 |
| 1985/86 | 2 | 2e ronde | < Rot-Weiß Erfurt: 0-5; kampioen BFC Dynamo II mag niet promoveren |
| 1986/87 | DDR-Oberliga | I | 13 | 1e ronde | < BSG Chemie Ilmenau: 1-3 |
| 1987/88 | DDR-Liga Groep A | II | 1 | 8e finale | < Hansa Rostock: 2-3; Liga-topscorer: Detlef Irrgang (25) |
| 1988/89 | DDR-Oberliga | I | 10 | 8e finale | < BSG Wismut Aue: 0-3 |
| 1989/90 | 7 | 1e ronde | < BSG Wismut Gera: 0-4 |
| 1990/91 | 13 | 2e ronde | < Chemnitzer FC: 0-2 |
| Energie Cottbus |
| 1991/92 | Oberliga Nordost#Mitte | III | 3 | -- |
| 1992/93 | 3 | -- |
| 1993/94 | 2 | -- | 3e in promotieserie met FSV Zwickau en BSV Brandenburg |
| 1994/95 | Regionalliga Nordost | 7 | -- | winnaar Landespokal > FV Motor Eberswalde: 2-1 |
| 1995/96 | 3 | 1e ronde | < SV Meppen: 1-2 (T); winnaar Landespokal > Frankfurter FC Viktoria: 1-0 |
| 1996/97 | 1 | Finale | < VfB Stuttgart: 0-2; promotieplay-off > Hannover 96: 0-0 (U) / 3-1 (T); winnaar Landespokal > Eisenhüttenstädter FC Stahl II: 6-1 |
| 1997/98 | 2. Bundesliga | II | 4 | 2e ronde | < SV Waldhof Mannheim: 3-4 (U); winnaar Landespokal > Eisenhüttenstädter FC Stahl: 2-1 |
| 1998/99 | 11 | 2e ronde | < Borussia Mönchengladbach: 2-4 (T) |
| 1999/00 | 3 | 8e finale | < SC Freiburg: 0-2 (U) |
| 2000/01 | Bundesliga | I | 14 | 2e ronde | < SSV Ulm 1846: 0-2 (U) |
| 2001/02 | 13 | 1e ronde | < KFC Uerdingen 05: 0-1 (U) |
| 2002/03 | 18 | 1e ronde | < 1. FC Kaiserslautern: 0-1 (T) |
| 2003/04 | 2. Bundesliga | II | 4 | 1e ronde | < VfL Wolfsburg II: 0-2 (U) |
| 2004/05 | 11 | 2e ronde | < Hannover 96: 2-2 (4-5 ns) (T) |
| 2005/06 | 3 | 2e ronde | < DSC Arminia Bielefeld: 1-2 (U) |
| 2006/07 | Bundesliga | I | 13 | 1e ronde | < Rot-Weiss Essen: 0-1 (U) |
| 2007/08 | 14 | 1e ronde | < Rot-Weiss Essen: 2-2 (5-6 ns) (U) |
| 2008/09 | 16 | 8e finale | > Bayer 04 Leverkusen: 1-3 (U); pd-wedstrijden > 1. FC Nürnberg: 0-3 (T) / 0-2 (U) |
| 2009/10 | 2. Bundesliga | II | 9 | 2e ronde | < TuS Koblenz: 2-4 (nv) (U) |
| 2010/11 | 6 | halve finale | < MSV Duisburg: 1-2 (U); Ligatopscorer: Nils Petersen (25). |
| 2011/12 | 14 | 1e ronde | < Holstein Kiel: 0-3 (U) |
| 2012/13 | 8 | 1e ronde | < SV Sandhausen: 0-3 (U) |
| 2013/14 | 18 | 2e ronde | < TSG 1899 Hoffenheim: 0-3 (nv) (U) |
| 2014/15 | 3. Liga | III | 7 | 1e ronde | < Hamburger SV: 2-2 (1-4 ns) (T); winnaar Landespokal > FSV Union Fürstenwalde: 3-2 |
| 2015/16 | 19 | 1e ronde | < 1. FSV Mainz 05: 0-3 (T) |
| 2016/17 | Regionalliga Nordost | IV | 2 | -- | winnaar Landespokal > FSV 63 Luckenwalde: 2-0 |
| 2017/18 | 1 | 1e ronde | < VfB Stuttgart: 2-2 (3-4 ns) (T); promotie play-off > SC Weiche Flensburg 08: 3-2 / 0-0; winnaar Landespokal > SV Babelsberg 03: 1-0 |
| 2018/19 | 3. Liga | III | 17 | 1e ronde | < SC Freiburg: 2-2 (3-5 ns) (T); winnaar Landespokal > FSV Optik Rathenow: 1-0 |
| 2019/20 | Regionalliga Nordost | IV | 3 | 1e ronde | < FC Bayern München: 1-3 (T); competitie afgebroken i.v.m. coronapandemie |
| 2020/21 | 9 | -- | competitie afgebroken i.v.m. coronapandemie |
| 2021/22 | 3 | -- |
| 2022/23 | 1 | 1e ronde | < Werder Bremen: 1-2 (T); promotie play-off > SpVgg Unterhaching: 1-2/0-2; winnaar Landespokal > FSV 63 Luckenwalde: 4-1 |
| 2023/24 | 1 | 1e ronde | < SC Paderborn 07: 0-7 (T); winnaar Landespokal > SV Babelsberg 03: 3-1 |
| 2024/25 | 3. Liga | III | 4 | 1e ronde | < Werder Bremen: 1-3 (T) |
| 2025/26 | . | 2e ronde | < RB Leipzig: 1-4 (T) |