Thermus is een geslacht van thermofiele bacteriën. Het is een van de meer bekende bacteriegenera die behoren tot het fylum Deinococcota (voorheen Deinococcus–Thermus). Vergelijkende genoomanalyses met behulp van 16S-rRNA wijzen erop dat het een evolutionair oude groep van bacteriën is.[1] Thermus-soorten kunnen worden onderscheiden van andere genera in de familie Thermaceae, evenals van alle andere bacteriën, door de aanwezigheid van acht geconserveerde indels (signature indels) in eiwitten zoals adenylaatkinase en replicatieve DNA-helicase. Daarnaast zijn er 14 geconserveerde signatuureiwitten geïdentificeerd die uitsluitend bij leden van dit geslacht zijn aangetoond.[2]
Habitat
De stammen van het geslacht Thermus zijn voornamelijk geïsoleerd uit hete omgevingen zoals hydrothermale bronnen waar de watertemperatuur varieert van 55–70 °C en de pH tussen 5,0 en 10,5 ligt.[3] Het eerste isolaat van het geslacht Thermus werd gevonden in warmwaterbronnen in Yellowstone National Park. Later werden andere isolaten gevonden in in thermale gebieden wereldwijd, zoals in Japan, IJsland, Nieuw-Zeeland, New Mexico en het Australische Artesian Basin.[3]
Fylogenie
De huidige taxonomie is gebaseerd op de List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN).[4] Een aantal opvallende soorten in het zijn T. thermophilus, die van belang is als modelorganisme voor fundamenteel en toegepast onderzoek, en de soort T. aquaticus, die bekendstaat om zijn rol in de ontwikkeling van de PCR-techniek.
| Thermus |
|
|
T. oshimai Williams et al. 1996[5] |
|
|
T. thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995[6] |
|
|
|
|
|
T. filiformis Hudson et al. 1987[7] |
|
|
|
T. composti Vajna et al. 2012[8] |
|
|
|
T. aquaticus Brock and Freeze 1969[9] |
|
|
|
T. arciformis Zhang et al. 2010[10] |
|
|
|
T. islandicus Bjornsdottir et al. 2009[11] |
|
|
|
T. sediminis Zhou et al. 2021 |
|
|
|
T. igniterrae Chung et al. 2000[12] |
|
|
|
|
T. hydrothermalis Li et al. 2023 |
|
|
|
T. brockianus Williams et al. 1995 |
|
|
T. thalpophilus Li et al. 2023 |
|
|
|
|
|
|
|
T. thermamylovorans Ming et al. 2020 |
|
|
|
|
T. caldilimi Li et al. 2021 |
|
|
T. tengchongensis Yu et al. 2013[13] |
|
|
|
|
|
T. caliditerrae Ming et al. 2014[14] |
|
|
|
|
T. brevis Hu et al. 2022 |
|
|
T. tenuipuniceus Zhou et al. 2019 |
|
|
|
|
|
|
T. caldifontis Khan et al. 2017 |
|
|
|
T. albus Li et al. 2023 |
|
|
T. altitudinis Li et al. 2023 |
|
|
|
|
|
|
|
T. neutrinimicus Li et al. 2023 |
|
|
|
T. amyloliquefaciens Yu et al. 2015[15] |
|
|
|
T. antranikianii Chung et al. 2000[12] |
|
|
T. scotoductus Kristjansson et al. 1994[16] |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Zie ook
Bronnen, noten en/of referenties
- ↑ (en) Woese, CR. (1987). Bacterial evolution. Microbiological Reviews 51 (2): 221–271. PMID 2439888. DOI: 10.1128/mr.51.2.221-271.1987.
- ↑ (en) Ho J, Adeolu M, Khadka B, Gupta R. (2016). Identification of distinctive molecular traits that are characteristic of the phylum "Deinococcus–Thermus" and distinguish its main constituent groups. Systematic and Applied Microbiology 39 (7): 453–463. PMID 27506333. DOI: 10.1016/j.syapm.2016.07.003.
- 1 2 (en) Da Costa, MS. (2006), 'The Genus Thermus and Relatives in: The Prokaryotes, Springer New York. DOI:10.1007/0-387-30747-8_32, 797–812. ISBN 978-0-387-25497-5.
- ↑ (en) J.P. Euzéby, Thermus. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Geraadpleegd op 20 juli 2025.
- ↑ (en) Williams RA, Smith K. (1996). Thermus oshimai sp. nov., Isolated from Hot Springs in Portugal, Iceland, and the Azores, and Comment on the Concept of a Limited Geographical Distribution of Thermus Species. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 46 (2): 403–408. PMID 8934898. DOI: 10.1099/00207713-46-2-403.
- ↑ Manaia, CMl (1995). Halotolerant Thermus Strains from Marine and Terrestrial Hot Springs Belong to Thermus thermophilus (ex Oshima and Imahori, 1974) nom. rev. emend.. Systematic and Applied Microbiology 17 (4): 526–532. DOI: 10.1016/S0723-2020(11)80072-X.
- ↑ (en) Hudson, J. A., Morgan, H. W., Daniel, R. M. (1987). Thermus filiformis sp. nov., a Filamentous Caldoactive Bacterium. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 37 (4): 431–436. DOI: 10.1099/00207713-37-4-431.
- ↑ Vajna, B., Kanizsai, S., Keki, Z., Marialigeti, K., Schumann, P. (1 juli 2012). Thermus composti sp. nov., isolated from oyster mushroom compost. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 62 (Pt 7): 1486–1490. PMID 21856987. DOI: 10.1099/ijs.0.030866-0.
- ↑ (en) Brock, Thomas D., Freeze, Hudson (1 april 1969). Thermus aquaticus gen. n. and sp. n., a Nonsporulating Extreme Thermophile. Journal of Bacteriology 98 (1): 289–297. ISSN: 0021-9193. PMID 5781580. PMC 249935. DOI: 10.1128/jb.98.1.289-297.1969.
- ↑ Zhang, X. Q., Ying, Y., Ye, Y., Xu, X. W., Zhu, X. F. (1 april 2010). Thermus arciformis sp. nov., a thermophilic species from a geothermal area. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 60 (4): 834–839. PMID 19661520. DOI: 10.1099/ijs.0.007690-0.
- ↑ Bjornsdottir, Snaedis H., Petursdottir, Solveig K., Hreggvidsson, Gudmundur O., Skirnisdottir, Sigurlaug, Hjorleifsdottir, Sigridur (1 januari 2009). Thermus islandicus sp. nov., a mixotrophic sulfur-oxidizing bacterium isolated from the Torfajokull geothermal area. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 59 (12): 2962–2966. PMID 19628590. DOI: 10.1099/ijs.0.007013-0.
- 1 2 Chung, A. P., Rainey, F. A., Valente, M., Nobre, M. F., Costa, M. S. da (1 januari 2000). Thermus igniterrae sp. nov. and Thermus antranikianii sp. nov., two new species from Iceland. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 50 (1): 209–217. PMID 10826806. DOI: 10.1099/00207713-50-1-209.
- ↑ Yu, Tian-Tian, Yao, Ji-Cheng, Ming, Hong, Yin, Yi-Rui, Zhou, En-Min (2013). Thermus tengchongensis sp. nov., isolated from a geothermally heated soil sample in Tengchong, Yunnan, south-west China. Antonie van Leeuwenhoek 103 (3): 513–518. PMID 23104072. DOI: 10.1007/s10482-012-9833-9.
- ↑ Ming, H., Yin, Y.-R., Li, S., Nie, G.-X., Yu, T.-T. (1 februari 2014). Thermus caliditerrae sp. nov., a novel thermophilic species isolated from a geothermal area. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64 (Pt 2): 650–656. PMID 24158953. DOI: 10.1099/ijs.0.056838-0.
- ↑ Yu, Tian-Tian, Park, Dong-Jin, Hozzein, Wael N., Kim, Chang-Jin, Wadaan, Mohammed A. M. (1 augustus 2015). Thermus amyloliquefaciens sp. nov., isolated from a hot spring sediment sample. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (8): 2491–2495. PMID 25920724. DOI: 10.1099/ijs.0.000289.
- ↑ Kristjánsson, Jakob, Hjörleifsdóttir, Sigrídur, Marteinsson, Viggó, Alfredsson, Gudni (1994). Thermus scotoductus, sp. nov., a Pigment-Producing Thermophilic Bacterium from Hot Tap Water in Iceland and Including Thermus sp. X-1. Systematic and Applied Microbiology 17 (1): 44–50. DOI: 10.1016/S0723-2020(11)80030-5.
Wikimedia Commons
Wikispecies